6月30日，荆门格林美公司关务经理陈爱平来到荆门海关政务大厅，顺利办理了114.7万美元氢氧化钴进口货物通关业务，并凭借关税保证保险单，获得了“先放后税”待遇，实现了货物快速通关。这是荆门海关成立后的首笔进出口业务，标志着荆门海关正式开办通关业务。
荆门海关前身为荆州海关驻荆门办事处，于2006年经海关总署批准设立。近年来，荆门市外向型经济发展迅猛，以格林美、大峪口化工、金龙非织造布为代表的一批骨干外贸企业迅速成长。2019年，荆门出口过亿元的企业达到16家，全市完成进出口总额96.4亿元，规模居全省第7位，业务量占荆州海关的比重过半。
2020年1月6日，荆门海关挂牌成立，负责管辖荆门市的海关业务，本地企业在“家门口”就可以享受海关服务。受新冠肺炎疫情影响，京山神地公司3栋鸡舍只建成了1栋，影响出口香港订单履约。6月底，荆门海关特事特办，上门指导修改申报材料和完善硬件设施，仅用1天时间就办好供港澳禽蛋养殖场备案手续，帮助企业7吨蛋液顺利出口香港。
荆门海关负责人表示，荆门海关将落实海关总署应对疫情影响促进外贸稳增长十条措施和武汉海关战疫情助复工稳外贸二十条措施，办理好通关、缴税、减免税、原产地证明等海关业务，帮助企业降低通关成本、提高通关实效，为提升对外开放形象、优化营商环境创造更好条件。